Di Indonesia sendiri, Rafflesia hasseltii hanyalah satu dari 14 spesies Rafflesia yang tumbuh di tanah air, dari total 25 spesies di dunia. Sebelas di antaranya berada di Pulau Sumatra.
Sayangnya, berbagai penelitian menunjukkan bahwa keberadaan Rafflesia semakin terancam. Menurut Community for the Conservation and Research of Rafflesia (CCRR), sekitar 60 persen spesiesnya berada dalam status terancam punah, sebagian mendekati kategori kritis. Ironisnya, 67 persen habitat mereka berada di luar kawasan konservasi, sehingga rentan terhadap perusakan.
Karena kondisi tersebut, Rafflesia hasseltii kini dilindungi oleh hukum melalui PP No. 7 Tahun 1999 dan tercatat sebagai spesies berstatus endangered dalam Daftar Merah IUCN.